腫瘤,中國腫瘤這一古老頑疾至今仍是科學(xué)人類健康的重大威脅。
然而,家合菌可精準(zhǔn)早于放療、成細(xì)化療等經(jīng)典腫瘤療法,消滅細(xì)菌溶瘤的中國腫瘤臨床應(yīng)用早在 150 余年前就已被報道。但出于安全性、科學(xué)可控性和療效等方面的家合菌可精準(zhǔn)顧慮,腫瘤細(xì)菌療法的成細(xì)研究陷入沉寂長達(dá)半個世紀(jì)之久。
近年來,消滅合成生物學(xué)的中國腫瘤發(fā)展使細(xì)菌療法重新煥發(fā)了生機(jī),越來越多的科學(xué)“細(xì)菌藥物”被報道具有實體瘤治療效果。然而,家合菌可精準(zhǔn)迄今為止仍然還有諸多問題懸而未決:
“細(xì)菌為何能治療惡性實體瘤?成細(xì)”“細(xì)菌如何逃過宿主免疫系統(tǒng)而不被殺死?”“細(xì)菌為何能定殖在腫瘤內(nèi)?”等等,這也成為了細(xì)菌療法無法邁向臨床、消滅服務(wù)患者的瓶頸問題。
2025 年 3 月 4 日,我們團(tuán)隊(中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院定量合成生物學(xué)全國重點實驗室劉陳立研究員團(tuán)隊)聯(lián)合中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康所研究員肖意傳團(tuán)隊等在學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》發(fā)表最新成果。
通過定量合成生物學(xué)研究成功構(gòu)建了一種特殊的工程菌(DB1),不僅揭示了上述問題的答案,還成功利用工程菌(DB1)實現(xiàn)消滅實體瘤。
“一種機(jī)制,三重功能”,本文將帶大家一起來看細(xì)菌如何借助定量合成生物學(xué)科技“重塑肉身”-DB1,化身“三頭六臂哪吒”,逃避宿主的免疫系統(tǒng)消滅癌細(xì)胞。
偉大發(fā)現(xiàn),“腫瘤細(xì)菌療法”問世
1868 年,德國醫(yī)生 Busch 發(fā)現(xiàn)患有惡性腫瘤的患者在感染丹毒后(現(xiàn)在稱為化膿性鏈球菌),腫瘤病灶得到了相應(yīng)緩解。
后來,外科醫(yī)生 William B. Coley 經(jīng)其啟發(fā),用滅活細(xì)菌制成為人津津樂道的科利毒素(Coley’s Toxins)。
但在當(dāng)時的年代,科利毒素的療效不可預(yù)測,后來興起的放療和化療以其可預(yù)測的療效被更多的醫(yī)生與患者采納,所以,細(xì)菌療法如曇花一現(xiàn)般匿跡在歷史中,無人再問津。
不過當(dāng)后人再次統(tǒng)計整理科利毒素的治療結(jié)果時,卻有了令人瞠目結(jié)舌的發(fā)現(xiàn):
科利毒素的療效與現(xiàn)如今的常規(guī)治療方法取得的成績旗鼓相當(dāng)!
如今,合成生物學(xué)賦予了細(xì)菌更多功能和多樣化的診療能力,例如,通過對細(xì)菌基因重編程,合成“細(xì)菌機(jī)器”響應(yīng)環(huán)境信號、靶向腫瘤、釋放藥物等。
但目前無論在學(xué)術(shù)界還是產(chǎn)業(yè)界,都還沒有細(xì)菌制劑走向臨床。究其原因,是細(xì)菌溶瘤的機(jī)制不清、療效不佳。
具體而言,細(xì)菌在腫瘤內(nèi)“偏安一隅”,表明其逃避了機(jī)體的抗微生物免疫防御系統(tǒng),但細(xì)菌抑制腫瘤卻說明了其激活了機(jī)體的抗腫瘤免疫系統(tǒng)。
這樣一種看似“自相矛盾”的免疫反應(yīng),背后的原因難以捉摸。
造物致知,我們合成抗瘤菌株“DB1”
為解析機(jī)制、揭開腫瘤細(xì)菌療法的神秘面紗,我們團(tuán)隊以沙門氏菌為底盤細(xì)胞,成功構(gòu)建了一種能在腫瘤組織中高效存活并大量增殖、而在正常組織內(nèi)發(fā)生裂解并被快速清除的菌株(Designer Bacteria 1, DB1)。
惡性實體腫瘤中分布著復(fù)雜的脈管系統(tǒng),就像“占山為王”的“土匪”,依賴新生血管源源不斷地掠奪給養(yǎng)。
實體腫瘤中的血管大多走形扭曲,血液流通不暢,導(dǎo)致實體瘤內(nèi)環(huán)境缺氧,從而形成中心厭氧區(qū)。
正是利用這一點,研究團(tuán)隊開發(fā)了能夠響應(yīng)氧氣濃度的啟動子來驅(qū)動細(xì)菌必需基因表達(dá),確保細(xì)菌在正常組織(有氧環(huán)境)快速死亡,而在實體瘤內(nèi)(低氧環(huán)境)可以生存增殖。
此外,研究團(tuán)隊引入了來自李斯特菌的溶血素蛋白 Listeriolysin O,增強(qiáng)了細(xì)菌穿透腫瘤組織的能力。
同時,為了降低沙門氏菌造成的生物安全風(fēng)險,研究團(tuán)隊敲除了沙門氏菌的毒性基因。
動物實驗顯示,DB1 能在腫瘤中高效定殖并持久存在,而在正常組織中則迅速消失,證明其具有很強(qiáng)的腫瘤“靶向性”。
創(chuàng)新發(fā)現(xiàn),細(xì)菌靶向腫瘤并非是“定向遷移”
正所謂“良禽擇木而棲”,細(xì)菌“靶向腫瘤”是如何實現(xiàn)的呢?
大家普遍認(rèn)為細(xì)菌是靠其自身的鞭毛主動“游”向腫瘤的。
但是研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),即便鞭毛被敲除,細(xì)菌仍然能夠選擇性地在腫瘤內(nèi)積累,這似乎暗示了細(xì)菌的靶向能力并非依賴其自身運(yùn)動,而是源于其在腫瘤環(huán)境中的特異性定殖能力。
為了驗證這一猜想,團(tuán)隊將定量合成生物學(xué)的概念方法和研究范式應(yīng)用到了這一研究中。
研究團(tuán)隊在對荷瘤小鼠尾靜脈給藥后的不同小時和不同天數(shù)間隔下,收集研磨小鼠主要器官和腫瘤樣品,通過在上千個細(xì)菌培養(yǎng)平板涂布后,證明了正常組織中活細(xì)菌的數(shù)量在細(xì)菌治療后的一周內(nèi)被清除殆盡,而腫瘤內(nèi)的活細(xì)菌數(shù)量在治療后 2 天內(nèi)增長了 10 倍(“偏好性生長”)。
厘清機(jī)制,細(xì)菌抗瘤的“致勝法寶”
研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),合成菌株 DB1 在結(jié)腸癌、黑色素瘤、膀胱癌等多種動物實驗?zāi)P蜕希颊宫F(xiàn)了優(yōu)異的治療效果。
透過現(xiàn)象看本質(zhì),細(xì)菌的抗瘤療效究竟從何而來?是細(xì)菌本身像“微型炸彈”一樣“爆破”了腫瘤么?還是說細(xì)菌像“鬧鐘”一樣喚醒了“沉睡”在實體瘤內(nèi)的免疫細(xì)胞?
帶著這樣的疑問,研究團(tuán)隊結(jié)合一系列定量實驗并構(gòu)建了數(shù)學(xué)模型,最終鎖定了細(xì)菌抗瘤的“致勝法寶”是免疫細(xì)胞因子白介素-10。
具體來說,團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),腫瘤里的免疫細(xì)胞具有一種獨特的“氣質(zhì)”(分子表型),即相對于正常組織中的兄弟姐妹,它們的表面上存在更多的白介素-10 受體。
正是由于這個特性,細(xì)菌才能夠讓腫瘤內(nèi)的巨噬細(xì)胞產(chǎn)生更多的細(xì)胞因子白介素-10。
“一把鑰匙一把鎖”,白介素-10 與駐留在腫瘤內(nèi)的 CD8+ T 細(xì)胞表面的白介素-10 受體結(jié)合,激活了 CD8+ T 細(xì)胞發(fā)揮抗瘤功能。
更有趣的是,細(xì)菌的天敵——中性粒細(xì)胞,也會像“貓鼠游戲”一樣,追逐細(xì)菌進(jìn)入實體瘤,形成一個圍繞在細(xì)菌周圍的“中性粒細(xì)胞圈”,但卻“圍而不剿”,究其原因也是白介素-10。
白介素-10 讓中性粒細(xì)胞運(yùn)動力下降,從而得以讓細(xì)菌借力白介素-10“免戰(zhàn)牌”躲過中性粒細(xì)胞的殺傷。
同時相反,正常組織中免疫細(xì)胞因為白介素-10受體水平低,細(xì)菌就無法讓巨噬細(xì)胞產(chǎn)生白介素-10,CD8+ T 細(xì)胞也不會被激活,中性粒細(xì)胞的運(yùn)動性也不會受抑制。因此,在正常組織中的細(xì)菌會被快速清除。
團(tuán)隊進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),腫瘤和正常組織白介素-10 受體水平的差異特性是一種稱為“遲滯效應(yīng)”的定量規(guī)律造成的。
這種現(xiàn)象能夠使免疫細(xì)胞對其之前經(jīng)歷過的白介素-10 刺激留下“深刻印象”,即細(xì)胞經(jīng)歷高濃度白介素-10 刺激后,即使白介素-10 濃度下降,白介素-10 受體的表達(dá)仍會保持在較高水平。
因此,細(xì)菌利用腫瘤內(nèi)免疫細(xì)胞白介素-10 受體表達(dá)高,而正常組織內(nèi)的免疫細(xì)胞表達(dá)低的特性,化身“六臂哪吒”把原本平靜的實體瘤微環(huán)境攪得天翻地覆(由“抗瘤免疫抑制”轉(zhuǎn)向“抗瘤免疫激活”),又利用這一機(jī)制躲避“抗菌免疫先鋒”中性粒細(xì)胞的殺傷,上演了一出“我命由我不由天”的好戲。
巧妙地實現(xiàn)了“既要靶向腫瘤,又要躲避免疫系統(tǒng),還要殺傷癌細(xì)胞”的三重目標(biāo)。
“雙輪驅(qū)動”,有望為惡性實體瘤患者帶來福音
此外,團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)這種“白介素-10 受體高表達(dá)”的現(xiàn)象在人類不同癌癥患者的組織中都有所體現(xiàn),即癌組織中的 CD8+ T 細(xì)胞白介素-10 受體表達(dá)量高于對應(yīng)正常組織中的表達(dá)量。
這說明了白介素-10 遲滯效應(yīng)的普遍性,同時也為基于白介素-10 的腫瘤免疫治療提供了新的理論依據(jù)和潛在策略。
目前,研究團(tuán)隊正基于這一重要發(fā)現(xiàn),設(shè)計并優(yōu)化新一代合成細(xì)菌療法,現(xiàn)正在向臨床實驗推進(jìn)。
通過突破性科學(xué)研究與產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用的“雙輪驅(qū)動”效應(yīng),隨著對白介素-10 遲滯效應(yīng)的深入解析,以及合成細(xì)菌療法在不同腫瘤類型和個體中的逐步研究,有望進(jìn)一步完善細(xì)菌免疫療法,持續(xù)推動定量合成生物學(xué)在癌癥治療領(lǐng)域的發(fā)展。
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